Die Musikschule kooperiert mit folgenden Schulen:
Realschule Schonungen - musischer Zweig - http://www.rs-schonungen.de/
Alexander-von-Humboldt-Gymnasium: Klavier, bei entsprechender Nachfrage Querflöte
Olympia-Morata-Gymnasium
Walther-Rathenau-Gymnasium mit Realschule: Schlagzeug
Die Musikschule kooperiert mit folgenden Grundschulen:
Auenschule Schweinfurt
Gartenstadtschule Schweinfurt
Kerschensteinerschule Schweinfurt
Dr.-Pfeiffer-Schule Schweinfurt
Friedrich-Rückert-Schule Schweinfurt
Grundschule Gerolzhofen
Hauptschule Stadtlauringen
In der Grundschule Grettstadt ist der Blockflötenunterricht der Musikschule in den Schulunterricht integriert.